奉军心大乱，不战而逃，连夜退回淯阳城。岑彭等将乘胜追击，董欣投降，淯阳也被迅速攻下。
邓奉又撤到小长安，刘秀下令强攻，毕竟实力悬殊，邓奉支持不住，就让被俘的朱祜出营请降。
刘秀考虑到邓奉是邓晨的侄子，而且是吴汉有错在先，就有意赦免他。诸将默然不语，岑彭和耿弇表态：“邓奉忘恩叛逆，干戈再起，贾复负伤，朱祜被俘。而陛下亲征以后，他不知悔改，坚持顽抗，直到穷途末路才投降。如果不杀，不足以惩戒后来者。”为了实现两大集团目前的团结，刘秀最终选择了大义灭亲。
后来又有南阳派贾复与河北派寇恂险些火并
贾寇事件是指贾复与寇恂的冲突，与邓奉事件几乎是同时发生的。贾复与阴识等人率军攻克颍川后，转兵汝南，刘秀改任寇恂为颍川太守，署理政务。贾复的部将在颍川杀人，寇恂执法如山，将其斩首示众。
战争时期，法纪不严，往常这些事情都是睁一只眼闭一只眼。再加上两大集团的固有矛盾，贾复很生气，后果很严重。
贾复的脾气由来已久，初归刘秀之时，就与同僚发生过不愉快。当时他是破虏将军名下的官属，在一次会议上，与大司马名下的官属段孝并排而坐。段孝提醒他：“你是将军督，我是大司马督，不能坐在一起。”贾复怒了：“大司马和破虏将军都是刘公，凭什么不能坐！”大家觉得他盛气凌人，想把他排挤走，被刘秀压了下来。
贾复虽是儒生，武力却很高。
贾复回师颍川，发狠话说：“我跟寇恂官职并列，现在却被他羞辱，有仇不报非君子，我见寇恂，一定要亲手杀了他！”
好在寇恂是个明白人，故意躲着贾复，手下不忿，说愿带剑护卫，以防不测。寇恂说：“当年蔺相如不惧秦王，却躲着廉颇，是为国事。古人尚且如此，我怎么能忘了呢？”
他下令各县沿途欢迎贾复，酒肉双份，吃喝管够，自己则称病不出。贾复余怒未消，还要找寇恂算账，结果将士们都喝得酩酊大醉，只好作罢。
寇恂担心贾复不肯罢休，就上报刘秀，刘秀对邓奉事件心有余悸，决定亲自出面调解。他先召贾复，晓以大义，又召寇恂。寇恂进殿，发现贾复已经在座，就准备转身离开，刘秀叫住了他：“如今天下未定，二虎怎能私斗，朕特来劝解。”于是二人并席而坐，相逢一笑泯恩仇。-->>