但是入了中原之后，问题就发现了。
治理县郡的人手远远不足，虽然也有不少读书人来投靠，但是努尔哈齿心里也清楚，这些人大部分都是科举落第的举子，又或是家中贫寒，受人排挤的寒门黔首子弟。
所以才会珍惜出头的机会。
可是这些人却代表不了中原的主流文人。
诸子百家之中，墨家隐世，纵横家少有生存的土壤，道家不理世事。
在主流仕子之中，还是以儒家和法家为主。
特别是儒家子弟，重礼法，对于神州之外的异族，看不上眼。
所以像努尔哈齿这样的出身是很难得到支持的。
这个时候，齐州孔府便起到了关键作用了。
夫子而为万世师，子曰而为天下法。
孔圣不仅仅是在儒家之中地位崇高，在其他各门之中的地位也不低。
若是能够得到孔府的支持，那么努尔哈齿便能够得到更多仕子的效忠。
努尔哈齿需要足够的威望和名声，而天下想为异族效力的仕子，需要一个台阶。
所以孔府的不可替代性就体现出来了。
无论逐鹿天下的是谁，最后都需要孔府的出面支持。
所以这次孔家北宗才让孔有德作为孔家的代表加入了后金军中。
孔圣的声望和遗泽，注定了孔家可以当墙头草。
虽有违儒家风骨，但是有风骨的人不是死在百年前的异族入侵，就是不愿为异族效力，南下衢州，建立了孔家南宗。
大乾太祖于至元十九年下诏访查，认定当时的南宗衍圣公孔洙为圣裔正统，遂诏孔洙入朝，命归曲阜袭封。
然南宗之主孔洙不愿为异族效力，以“先祖庙墓在衢”为由，辞爵不就，让爵于曲阜族弟孔治。后孔治袭封衍圣公，结束了两公共存的尴尬局面，但南北两宗依旧各自奉祀家庙，代代传承。
在太祖收服天下之后，想要让南宗北归。
但南宗辞爵多年，不愿接受衍圣公的爵位，于是太祖便就此作罢。
从孔府北宗为孔圣正统。